教师简介

  

 

 

 

 

个人简介

王圣钦,工学博士,讲师。于东南大学(生物电子学国家重点实验室)获得生物医学工程专业博士学位,研究方向为非编码RNA相关的生物信息学分析。2011-2012年获国家留学基金资助,在美国 Baylor College of Medicine 开展癌症相关的转录组数据分析。现就职于温州大学,从事衰老相关的生物数据分析与大数据挖掘的研究。

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

代表性论文

Wang S, Sun B, Tu J, Lu Z. Improving the microbial community reconstruction at the genus level by multiple 16S rRNA regions. J Theor Biol. 2016 Jun 7;398:1-8. doi: 10.1016/j.jtbi.2016.03.016.

Wang S, Xu Y, Li M, Tu J, Lu Z. Dysregulation of miRNA isoform level at 5' end in Alzheimer's disease. Gene. 2016 Jun 15;584(2):167-72. doi:10.1016/j.gene.2016.02.020.

Wang S, Tu J, Wang L, Lu Z. Entropy-based model for miRNA isoform analysis. PLoS One. 2015 Mar 18.

Wang S, Tu J, He C, Lu Z. High order intra-strand partial symmetry increases with morphological complexity in animal evolution. Scientific Reports. 2014 Sep 15.

Wang S, Xu Y, Lu Z. Genome-wide miRNA seeds prediction in Archaea. Archaea. 2014 May 14.

Wang S, Lu Z. In silico prediction of miRNA gene in Archaea. International Journal of Terraspace Science and Engineering. 2014.

Wang L, Park HJ, Dasari S, Wang S, Kocher JP, Li W. CPAT: Coding-

Potential Assessment Tool using an alignment-free logistic regression model. Nucleic Acids Res. 2013 Apr 1.

Wang L, Wang S, Li W. RSeQC: quality control of RNA-seq experiments. Bioinformatics. 2012 Aug 15.

Tu J*, Ge Q*, Wang S, Wang L, Sun B, Yang Q, Bai Y, Lu Z. Pair-barcode high-throughput sequencing for large-scale multiplexed sample analysis. BMC Genomics. 2012 Jan 25.

Yang Q, Lu J, Wang S, Li H, Ge Q, Lu Z. Application of next-generation sequencing technology to profile the circulating microRNAs in the serum of preeclampsia versus normal pregnant women. Clin Chim Acta. 2011 Nov 20.

Lu J, Bao Q, Wu J, Wang H, Li D, Xi Y, Wang S, Yu S, Qu J. CSCDB: the cAMP and cGMP signaling components database. Genomics. 2008 Jul.

Wu J, Wang S, Bai J, Shi L, Li D, Xu Z, Niu Y, Lu J, Bao Q. ArchaeaTF: an integrated database of putative transcription factors in Archaea. Genomics. 2008 Jan.

Wu J, Zhao F, Wang S, Deng G, Wang J, Bai J, Lu J, Qu J, Bao Q. cTFbase: a database for comparative genomics of transcription factors in cyanobacteria. BMC Genomics. 2007 Apr 18.

 

 

 

研究方向和课题承担

研究兴趣:

1.衰老相关的高通量测序数据分析与模型构建;

2.生物大数据与文本挖掘。

在研项目:

1. 国家自然科学基金青年项目,61601332miRNA表达谱二维分析法及其在神经退行性疾病研究中的应用,2017-2019,主持;

2. 温州市科技计划专项项目,Z20160016,基于基因组学的羊栖菜种质资源研究,2017-2019,主持;

3. 浙江省自然科学基金青年项目,LQ16F010009,基于熵的阿尔兹海默病miRNA表达谱分布特征研究及相关平台构建,2016-2018,主持;

4. 浙江省教育厅一般科研项目,Y201533114,阿尔兹海默病miRNA表达谱分布特征的建模分析,2015-2017,主持;

5. 国家自然科学基金面上项目,31670402,硅藻适应铁限制海区环境机制中铁载体的作用解析,2017-2020,参与;

6. 浙江省教育厅一般科研项目,Y201635459Pseudomonas putida DLL-E4代谢阻遏基因敲除菌株的构建,2016-2018,参与;

7. 温州市科技计划一般项目,N20150034,羊栖菜多糖抗氧化和抗衰老功能的开发和研究,2015-2017,参与;

8. 国家自然科学基金面上项目,61372164,基于因子图的K562 跨组学基因调控网络的构建与分析,2014-2017,参与;

 

已结题的项目:

1. 国家自然科学基金面上项目,61171143,单碱基变异的生物信息学研究, 2012/01-2015/12,参加;

2. 国家自然科学基金,61001175,蛋白质结构域组合网络拓扑结构比较分析及其网络演化模型的研究,2011/01-2013/12,参加;

3. 国家自然科学基金,30800643,病原细菌转录因子生物信息学预测与整合分析平台的搭建, 2009/01-2011/12,参加。

 

专著及获奖情况

专著:

Li X, Nair A, Wang S, Wang L. Quality control of RNA-seq experiments. Springer New York. 2015

承担主要课程

生物信息学,普通生物学

联系电话

13867727151(667151)

电子邮箱

mysango@163.com